A más de 24 horas se extendió la jornada de las Juntas Receptoras de Votos por un fallo en el sistema de transmisión de resultados que se registró en varios centros de votación, retrasando así la logística de las mesas, uno de estos fue el centro de votación ubicado sobre la avenida Olímpica, uno de los más grandes de San Salvador.
En la madrugada del 5 de febrero, el Tribunal Supremo Electoral durante una sesión extraordinaria aprobó que se emitieran las actas de forma manual para el escrutinio final de las elecciones presidenciales y de diputados, reconociendo las dificultades en la transmisión de resultados, falta de seguridad y factores ajenos al ente colegiado.
Por su parte, algunos partidos políticos calificaron como un fracaso el sistema de transmisión de datos y señalaron que era una publicidad engañosa la que se hizo de la tecnología a utilizar.
Para las elecciones de alcaldes y Parlamento Centroamericano, que se llevaran a cabo el 3 de marzo, tanto el TSE como los integrantes de las JRV, esperan que estos inconvenientes que paralizaron por completo su trabajo durante varias horas, sean resueltos.