En total 11 municipios se encuentran bajo alerta naranja. Autoridades indicaron que cerca de 11 municipios se encuentran en alerta naranja, debido a que el huracán Bonnie dejó de influenciar con lluvias el territorio salvadoreño. Asimismo, 31 municipios se encuentran en alerta amarilla y el resto del país en alerta verde.
En la Asamblea Legislativa fue declarado el estado de emergencia nacional por 15 días debido a las afectaciones tras el paso del huracán Bonnie.