Los 11 juzgados contra el crimen organizado instalados en tres departamentos, ya iniciaron labores, San Salvador cuenta con seis tribunales que resolverán casos de la zona central y paracentral, Santa Ana tiene tres que también atenderán procesos de Sonsonate y Ahuachapán; mientras que a San Miguel le fueron asignados dos, los cuales además tendrán competencia en los departamentos de Usuluán, Morazán y La Unión.
Los 18 jueces que estarán al frente de las nuevas instancias fueron juramentados por los magistrados de la Corte Suprema de Justicia con 14 votos en corte plena.
Estos juzgados atenderán los casos de personas capturadas bajo el régimen de excepción, de acuerdo con las reformas realizadas a la ley orgánica judicial.
Dichas enmiendas también incluyen la creación de juzgados de garantías y la conversión de tribunales de paz y de instrucción. Con la creación de estas instancias se cerraron tres juzgados de instrucción y tres de paz en San Salvador, mientras que los especializados de apoyo formarán parte de las nuevas sedes de justicia.
La reforma al artículo 3 de la ley orgánica judicial establece que los tribunales contra el crimen organizado estarán compuestos por cuatro jueces propietarios quienes contarán con sus respectivos suplentes. Uno de ellos deberá ser juez de menores designado por la Corte Suprema de Justicia y será competente exclusivamente para conocer del juzgamiento de los mismos, en los casos que concurran dentro de un proceso junto con adultos; y se le denominará como juez de garantías para el menor.